Помощни звена
Техническа работилница:
Техническата работилница е предназначена за ремонт и поддръжка на научното оборудване, както и за създаване на прототипи на научна апаратура. За целта тя е оборудвана с необходимите машини и инстременти и в нея работи квалифициран персонал.
НИБ "Шкорпиловци":
Научно-изследователската база „Шкорпиловци“ е предназначена за провеждане на научни изследвания в природни условия в бреговата зона, обучение на специалисти и провеждане на научни конференции и семинари.
НИК "Академик":
НИК АКАДЕМИК е многоцелеви, универсален научно-изследователския кораб, предназначен за провеждане на научни изследвания на море. За целта корабът е оборудван и обзаведен със съвременна навигационна и научно-изследователска апаратура и оборудване и комплектован с квалифициран и добре обучен екипаж.
ФС и РЗ:
Осъществява финансово-счетоводната дейност на Института
АСО:
Осъществява административно-стопанкото обслужване на Института.
Научна информация:
От 1977 г. започва да функционира институтската библиотека, във фонда на която се съхраняват над 10000 библиотечни единици – книги, периодични издания, научни проекти и отчети, ксерокопия, карти.